2016年全年各类运输方式完成货运总量4808.7万吨，比上年增长6.5%。其中，公路4775万吨，增长6.3%；水运16.0万吨，下降3.1%；铁路17.5万吨，增长111.8%；民航货邮吞吐量2067吨，下降1.7%。完成旅客运输总量4016.8万人，比上年下降7.1%。其中，公路3584万人，下降9.5%；水运109万人，增长18.5%；民航旅客吞吐量60.5万人，增长2.4%；铁路（含高铁）263.3万人，增长25.2%。年末,全市公路线路里程6937公里，其中：高速公路353公里。
年末全市民用汽车拥有量16.66万辆，比上年增长13.3%，其中私人汽车13.73万辆，增长22.6%。民用轿车拥有量13.42万辆，增长23.9%，其中私人轿车12.42万辆，增长27.1%。
公路
截至2010年，黄山市已有公路2521千米，道路等级状况分别是：二级路329千米，三级路531千米，四级公路1503千米，等外路158千米，另有村道2526千米，每万人占有道路约17千米。黄山市境内还有1条国道和9条省道穿城而过。2004年10月，徽杭高速正式通车；2007年9月，黄山市第2条高速公路——合铜黄高速全线贯通；2008年12月，连接浙江瞥州和江西婴源的黄塔桃高速建成通车。
铁路
截至2010年，黄山市境内有一条皖赣铁路，火车站主要有黄山站、黄山北站和歙县北站，经过黄山市境内从黄山始发的列车有3条线，分别是黄山一淮北、黄山一上海和黄山一南京西，其他都是过路车。这3条线路主要停靠站是淮北、蚌埠、合肥、上海、苏州、无锡、南京。
航空
黄山市有一个对外口岸机场——黄山屯溪国际机场（简称黄山机场），与周围的火车站、汽车站相衔接。黄山机场始建于1958年，是国家规划的67个枢纽（干线）机场之一，1996年9月经国务院批准为国家一类口岸先后经历4次扩建，开通了至北京、上海、广州、重庆、成都等主要城市的国内航线19条，以及至香港、澳门、日本、韩国的直航包机。2008年12月，总投资3.03亿元的黄山机场改建工程拉开建设序幕；2010年9月2日，黄山航空口岸扩大对外开放通过国家级验收。